Υποδομές
Το κτίριο του Τμήματος Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης είναι πρόσφατης κατασκευής (1996) και εκτείνεται σε 9.060 m2 εκ των οποίων 5.360 m2 είναι ο ωφέλιμος χώρος. Στο Τμήμα Βιολογίας λειτουργούν τόσα ερευνητικά εργαστήρια όσα και τα μέλη ΔΕΠ του Τμήματος (50-70 m2 έκαστο), ενώ υπάρχουν εγκαταστάσεις Ηλεκτρονικού Μικροσκοπίου (Θεσμοθετημένο Εργαστήριο, 135 m2), ακτίνων Χ για μελέτες δομικής Βιολογίας (συνεργασία Ινστιτούτου Μοριακής Βιολογίας και Πανεπιστημίου Κρήτης), ICP-MS, Αυτόματος Ζυμωτήρας για μεσαίας κλίμακας μικροβιακές καλλιέργειες, Αυτόματος αναλυτής αλληλουχιών DNA, Ζωοτροφείο (275 m2), Εντομοτροφείο (190 m2), και Θερμοκήπιο (800 m2) για τις εκπαιδευτικές και ερευνητικές ανάγκες του Τμήματος. Επίσης υπάρχουν και γενικές εγκαταστάσεις καθαρισμού/απιονισμού ύδατος και υγρής/ξηράς αποστείρωσης, ψυκτικοί θάλαμοι/εργαστήρια για βιοχημικές/μοριακές εργασίες και Ηλεκτρονικό εργαστήριο. Στα ερευνητικά εργαστήρια διατίθεται μοντέρνος εξοπλισμός για μοριακές, δομικές, βιοχημικές, βιοενεργητικές, φυσιολογικές και περιβαλλοντικές μελέτες. Ο εργαστηριακός εξοπλισμός και οι διαθέσιμες υποδομές καλύπτουν όλες τις ερευνητικές ανάγκες του Τμήματος και φυσικά και τις απαιτήσεις του ΠΜΣ-Μοριακή Βιολογία και Βιοτεχνολογία Φυτών με τον καλύτερο τρόπο.
ΥΠΟΔΟΜΕΣ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΩΝ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΩΝ
Το Εργαστήριο του Καθ. Κυριάκου Κοτζαμπάση (Βιοχημεία Φυτών & Φωτοβιολογία) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει ~60 m2, με επιπλέον βοηθητικό κοινόχρηστο χώρο μηχανημάτων (~30 m2) , και 2 χώρους με ελεγχόμενες συνθήκες φωτισμού, θερμοκρασίας και υγρασίας για φωτοβιολογικές εφαρμογές και χώρο με ειδικές εγκαταστάσεις για την καλλιέργεια μικροφυκών.
Ο εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι εγκατεστημένος στους χώρους αυτούς ενδεικτικά περιλαμβάνει:
- Δύο ειδικά συστήματα, απόλυτα ελεγχόμενων συνθηκών φωτισμού και CO2, για αυτότροφες και μικτότροφες καλλιέργειες φωτοσυνθετικών μικροοργανισμών.
- Ειδικούς growth chambers για ετερότροφη καλλιέργεια μικροοργανισμών.
- Συστήματα χρωματογραφίας HPLC (με diode array) και FPLC για βιοχημικές αναλύσεις.
- Συστήματα επαγωγικού φθορισμού (PEA & PAM) για την καταγραφή της μοριακής δομής και λειτουργίας του φωτοσυνθετικού μηχανισμού και κατ' επέκταση της γενικής κατάστασης των φυτών in vivo.
- Σύστημα ECS (Electrochromic Shift) για εξειδικευμένες μετρήσεις της πρωτονιοκινητικής δύναμης (proton motive force, pmf) των θυλακοειδών και την κατανομή της σε ΔpH (οσμωτική) και Δψ (ηλεκτρική) συνιστώσα.
- Φθορισμόμετρο για μετρήσεις εκπομπής φθορισμού (fluorescence emission) και διέγερσης φθορισμού (fluorescence excitation).
- Φασματοφωτόμετρο υψηλής ταχύτητας και ευαισθησίας.
- Σύστημα πολαρογραφίας για την καταγραφή φωτοσυνθετικής δραστηριότητας και αναπνοής.
- Σύστημα περιστροφικής εξάτμισης (Rotary Evaporator System).
- Φυγόκεντρους.
- Όλα τα παραπάνω σε συνδυασμό με τις κοινόχρηστες εγκαταστάσεις καθαρισμού/απιονισμού ύδατος, υγρής/ξηράς αποστείρωσης και λυοφιλοποίησης, καλύπτουν όλες τις ερευνητικές ανάγκες του Εργαστηρίου με τον καλύτερο τρόπο.
To Εργαστήριο της Ομότιμης Καθ. Καλλιόπης Α. Ρουμπελάκη-Αγγελάκη (Φυσιολογία & Βιοτεχνολογία Φυτών) καταλαμβάνει χώρο περ. 60 m2, με επιπλέον χώρο κοινόχρηστων οργάνων, καθώς και κοινόχρηστο θερμοκήπιο 400 m2. Διαθέτει όλον τον απαραίτητο εξοπλισμό για την πραγματοποίηση έρευνας σχετικής με τη Μοριακή Φυσιολογία Φυτών αλλά και την εφαρμογή βιοτεχνολογικών μεθόδων. Συγκεκριμένα, το Εργαστήριο διαθέτει:
- θαλάμους ελεγχόμενης ανάπτυξης φυτών με δυνατότητα ρύθμισης της θερμοκρασίας, υγρασίας και της φωτοπεριόδου,
- θερμικούς αναδευτήρες και κλιβάνους ανάπτυξης φυτικών κυττάρων,
- απεικονιστικό σύστημα σε πραγματικό χρόνο,
- βαθιά κατάψυξη και θαλάμους συντήρησης,
- κλίβανο υβριδισμού, μικρές και μεγάλες φυγοκέντρους,
- κάθετες και οριζόντιες συσκευές ηλεκτροφορητικής ανάλυσης νουκλεινικών οξέων,
- συσκευές ανάλυσης πρωτεϊνών απλής και διπλής διάστασης,
- θάλαμο νηματικής ροής,
- συσκευή ηλεκτροπόρωσης ευκαρυωτικών και προκαρυωτικών κυττάρων,
- συσκευές PCR, συσκευή ποσοτικού PCR σε πραγματικό χρόνο,
- HPLC,
- διάφορα στερεοσκόπια συνδεδεμένα με ηλεκτρονικό υπολογιστή,
- θάλαμο χρήσης ραδιοισοτόπων,
- θάλαμο υγρού υβριδισμού,
- φασματοφωτόμετρα.
- Επίσης, δύο θαλάμους νηματικής ροής για στείρες συνθήκες καθώς και ένα αυτόκαυστο.
- Μικροόργανα, όπως pHμετρα, αναδευτήρες θερμομπλόκ κ.α. αποτελούν μια βασική αλλά ουσιαστική υποδομή.
Tο Εργαστήριο του Ομότιμου Καθ. Νικολάου Πανόπουλου (Βιοτεχνολογια Φυτών - Μοριακή Φυτοπαθολογία) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει ~60 m2, με επιπλέον βοηθητικούς κοινόχρηστους χώρους μηχανημάτων (~30 m2) και ξεχωριστούς χώρους για εξοπλισμό, που περιλαμβάνει:
- Εστίες νηματικής ροής για προετοιμασία μικροβιακών καλλιεργειών υπο ασηπτικές συνθήκες
- Υπερκαταψύκτη -80οC για τη διατήρηση μικροβιακών στελεχών/οργανισμών
- Επωαστήρες για μικροβιακές καλλιέργειες με ελεγχόμενες συνθήκες θερμοκρασίας
- Ειδικούς θαλάμους ανάπτυξης φυτών με ελεγχόμενη θερμοκρασία/υγρασία
- Φυγόκεντρους
- Στερεοσκοπιο, PCR, συκευή υπεριώδους φωτισμού, και άλλα μικροόργανα
Τα παραπάνω, σε συνδυασμό με τις κοινόχρηστες εγκαταστάσεις καθαρισμού/απιονισμού ύδατος, υγρής/ξηράς αποστείρωσης και λυοφιλοποίησης, τον εξοπλισμό του συνεργαζομενου εργαστηριου Δομικης Βιολογιας και του ΙΜΒΒ, και το ερευνητικό θερμοκήπιο καλύπτουν επαρκώς τις ερευνητικές ανάγκες του Εργαστηρίου.
Το Εργαστήριο της Καθ. Ειρήνης Αθανασάκη (Ανοσοβιολογία) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει ~60 m2, με επιπλέον βοηθητικό χώρο κυτταροκαλλιεργειών (~15 m2) και χώρο εκτροφής πειραματικών μυών (~ 100 m2).
Ο εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι εγκατεστημένος στους χώρους αυτούς ενδεικτικά περιλαμβάνει:
- Κυτταρικό επωαστή με παροχή CO2.
- Εστία κάθετης και οριζόντιας ροής
- Κυτταρομετρητή ροής
- Αντεστραμμένο μικροσκόπιο και Μικροσκόπιο φθορισμού
- Φασματοφωτόμετρο
- Φυγοκέντρους
- Συστήματα χρωματογραφίας
- Ζυγούς ακριβείας
Τα παραπάνω σε συνδυασμό με τις κοινόχρηστες εγκαταστάσεις συνεστιακής και ηλεκτρονικής μικροσκοπίας, κυτταρικού διαχωριστή, καθαρισμού/απιονισμού ύδατος, υγρής/ξηράς αποστείρωσης, μετρητή β-ακτινοβολίας, όπως και η συνεργασία με άλλα εργαστήρια του Τμήματος για PCR, RT-PCR, υπερφυγοκέντρους, φασματόμετρα κλπ, καλύπτουν τις ερευνητικές ανάγκες του Εργαστηρίου με τον καλύτερο τρόπο.
Το Εργαστήριο του Αναπλ. Καθ. Ιωάννη Βόντα (Μοριακή Εντομολογία) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει περίπου 60 m2 και υποστηρίζεται από Εντομοτροφείο έκτασης 190 m2.
Ο εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι εγκατεστημένος σ' αυτούς τους χώρους περιλαμβάνει:
- Πλήρης εξοπλισμός εργαστηρίου μοριακής βιολογίας: Κυκλοποιητές PCR, ηλεκτροφορήσεις DNA/πρωτεϊνών, φυγόκεντροι κλπ)
- Εξοπλισμός για έκφραση και απομόνωση ανασυνδυασμένων πρωτεϊνών σε κυτταροκαλλιέργειες και βακτηριακά κύτταρα.
- Κυκλοφορητής πραγματικού χρόνου (Real Time PCR) – Biorad
- Σύστημα χρωματογραφίας υψηλής πίεσης Dionex
- Φασματοφωτόμετρο και φθορισμόμετρο πλάκας (M2e Spectra Max Plate Reader)
- Πέντε βιοκλιματικούς θαλάμους
Το Εργαστήριο του Επίκ. Καθ. Στέργιου Πυρίντσου (Οικολογία Φυτών & Διαχείριση Χερσαίων Οικοσυστημάτων) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει 60 m2 με επιπλέον βοηθητικούς χώρους κοινόχρηστων οργάνων, θάλαμο ελεγχόμενης θερμοκρασίας και φωτισμού, καθώς και κοινόχρηστο θερμοκήπιο.
Ο Εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι διαθέσιμος περιλαμβάνει:
- Μονάδα ανάλυσης εδαφικών και φυτικών δειγμάτων με Kυλίνδρους και πυκνόμετρα Bouyoucos, Ασβεστόμετρο Bernard, Μετρητές αγωγιμότητας και οξύτητας, Θερμικό αναδευτήρα, Συσκευή πέψης με μικροκύματα (core facility), Συσκευή λειοτρίβησης, Συσκευή Kjeldahl, Φασματοφωτόμετρο, Φλωγοφωτόμετρο Sherwood, ICP-MS (core facility), Θάλαμο σταθερής θερμοκρασίας, Καταψύκτες, Φυγόκεντρο και Κλίβανο υψηλών θερμοκρασιών.
- Μονάδα Μοριακής Οικολογίας και Συστηματικής με PCR, Gradient PCR, Sequencer (core facility), Συσκευή ηλεκτροφόρησης, Συσκευή φωτογράφησης gel (core facility), Υπερκαταψύκτη (-80 0C) και Εξειδικευμένο λογισμικό επεξεργασίας δεδομένων.
- Μονάδα GIS και Δορυφορικής Τηλεπισκόπησης με Ψηφιοποιημένα Υπόβαθρα, Δορυφορικές εικόνες και δεδομένα, Λογισμικό GIS, Λογισμικό επεξεργασίας δορυφορικών εικόνων και δεδομένων, Σύστημα GPS υψηλής ακρίβειας, Θεοδόλιχο και όργανα αποτύπωσης.
- Μονάδα Στερεοσκοπίας, Μικροσκοπίας με Στερεοσκόπια, Μικροσκόπιο, Κάμερα Lucida, Μικροσκόπιο φθορισμού (core facility), Συνεστιακό μικροσκόπιο (core facility) και Ηλεκτρονικό Μικροσκόπιο (core facility).
- Μονάδα συλλογής και επεξεργασίας περιβαλλοντικών δεδομένων με Λογισμικό αποθήκευσης, επεξεργασίας και παρουσίασης δεδομένων και
- Herbarium για την κάλυψη ερευνητικών και διδακτικών αναγκών.
Τα παραπάνω συμπληρώνονται με συσκευή καθαρισμού/απιονισμού ύδατος, συσκευή εξάτμισης υπό κενό και κλίβανο ξηράς αποστείρωσης που βρίσκονται σε κοινόχρηστο βοηθητικό χώρο και καλύπτουν επαρκώς τις ερευνητικές ανάγκες του Εργαστηρίου.
Το Εργαστήριο του Καθ. Κρίτωνα Καλαντίδη (Μοριακή και Αναπτυξιακή Βιολογία Φυτών) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει ~60 m2 με επιπλέον βοηθητικό κοινόχρηστο χώρο μηχανημάτων (~20 m2). Επίσης χρησιμοποιεί κλιματιζόμενους θαλάμους ανάπτυξης φυτών (~60 m2) στο σύγχρονο θερμοκήπιο του Τμήματος.
Ο εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι εγκατεστημένος στους χώρους αυτούς ενδεικτικά περιλαμβάνει:
- Τρείς ειδικούς βιοκλιματικούς θαλάμους ανάπτυξης φυτών
- Τράπεζες νηματοειδούς ροής για ιστοκαλλιέργειες
- Δύο μηχανήματα αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR)
- Συσκευές κάθετης και οριζόντιας ηλεκτοφόρησης
- Συσκευές ημι-ξηρού και υγρού στυπώματος πηκτωμάτων σε μεμβράνες
- Φυγοκέντρους
- Ζυγούς ακριβείας
- Συσκευή βιο-βαλλιστικής (Helios Gene Gun) (Με Επίκ. Καθ. Μίνα Τσαγρή)
Το Εργαστήριο της Επίκ. Καθ. Ευθυμίας Τσαγρή (Μοριακή Βιολογία Φυτών και Ιολογία) του Τμήματος Βιολογίας καλύπτει περίπου 60 m2 με επιπλέον βοηθητικό χώρο μηχανημάτων και κοινόχρηστο θερμοκήπιο.
Ο εργαστηριακός εξοπλισμός που είναι διαθέσιμος περιλαμβάνει:
- Επιτραπέζιες φυγοκέντρους
- Επωαστήρες ρυθμιζόμενης θερμοκρασίας
- Εστίες νηματικής ροής για εργασία σε αποστειρωμένες συνθήκες (core facility)
- Αναδευτήρες
- Επωαστήρας για ανάλυση νουκλεινικών οξέων
- Nanodrop φωτομετρο (core facility)
- Φωτογραφικό σύστημα για τεκμηρίωση
- Συσκευές ηλεκτροφόρησης για πρωτείνες και νουκλεινικά οξέα
- Ψυκτικό θάλαμο
- Θαλάμους ανάπτυξης φυτών (core facility)
- Υδατόλουτρα
- Καταψύκτες
- Καταψύκτης βαθιάς κατάψυξης
- Ψυγεία